南京中医药大学是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校,2017年入围国家“双一流”建设和江苏高水平大学建设高校，2019年成为教育部与江苏省共建的“双一流”建设高校。
南京中医药大学始建于1954年，是全国建校最早的高等中医药院校之一。1981年，经国务院批准成为首批具有硕士学位、博士学位授权单位，中医内科学成为博士学位授权点。1995年，经国家人事部批准，设立第一个中医学博士后科研流动站。1998年，成为首批临床医学博士、硕士专业学位试点单位。
南京中医药大学现有国家重点学科3个，国家重点（培育）学科2个，江苏高校优势学科4个。江苏省重点学科10个，国家中医药管理局中医药重点学科33个。在全国第四轮学科评估中，中医学、中药学、中西医结合三个主干学科均进入A类。临床医学、药理学与毒理学2个学科进入ESI全球排名前1%，2017年入围U.S.News世界大学排行榜，2018年上榜自然指数国内高校TOP200，入围Scimago中国大学“学术”排名前128强。
南京中医药大学有中医学、中药学、中西医结合、护理学4个一级学科及中医1个专业学位博士学位授权点。11个一级学科硕士学位授权点：中医学、中药学、中西医结合、护理学、药学、生物学、基础医学、临床医学、公共管理、科学技术史、软件工程。5个专业学位授权点：中医、中药学、药学、护理、应用心理。3个博士后科研流动站：中医学、中药学、中西医结合。
南京中医药大学始终坚持以学生为中心，肩扛立德树人根本使命，着力推进卓越医生（中医学9年本博一贯制、“5+3”创新拔尖人才）、卓越科学家（中药学“4+5”本博连读创新拔尖人才）和卓越工程师（中药学/药学本硕连读应用人才）培养模式。先后获得中国学位与研究生教育学会研究生教育成果奖二等奖1项，江苏省研究生教育教学改革成果一等奖1项、二等奖1项，江苏省研究生招生管理考核工作“优秀单位”。
在长期的办学实践中，南京中医药大学秉承“学贯中西，至精至诚”的办学理念，围绕“办强研究生教育”的办学定位，坚持特色发展，追求卓越，各项事业快速发展。面向未来，南京中医药大学将进一步解放思想，深化改革，继续坚持特色发展，加强内涵建设，为创建高水平、有特色、国际化的一流中医药大学而努力奋斗。
